Program uključuje multidisciplinranu primjenu biokemije, mikrobiologije, temeljnih inženjerskih disciplina i biokemijskog inženjerstva u rješavanju interdisciplinarnih zadataka.
Diplomski studij bioprocesno inženjerstvo, koji se kao studijski smjer održava i po starim programima, organiziran je u okviru novih programa kao samostalan studij i neposredno se nastavlja na preddiplomski studij biotehnologije te ima naglašeno inženjersko obrazovanje kojim se studenti osposobljavaju za planiranje, projektiranje i vođenje biotehnoloških procesa. Magistar bioprocesnog inženjerstva jest stručnjak koji svoje biološko i inženjersko znanje prenosi u industrijsku proizvodnju te u procese prerade i čuvanja biološkog materijala i obrade otpadnih voda i materijala.
Voditelj studija: prof.dr.sc. Božidar Šantek
Red predavanja i vježbi i ispitni rokovi.