Bioinformatika
Nositelj |
|
ECTS bodovi: |
Studij: |
Šifra predmeta: |
Opis predmeta
SADRŽAJ PREDMETA
- Osnove bioinformatike
- Bioinformatika u genomici
- Bioinformatika u proteomici
- Algoritmi u bioinformatici
ISHODI UČENJA
- navesti prihvatljivu definiciju bioinformatike kao i njezina područja primjene
- nabrojati i navesti glavne bioinformatičke izvore podataka
- nabrojati i opisati glavne alate za pretragu dvaju najčešće korištenih izvora podataka u bioinformatici
- konstruirati logičan upit za ciljani dohvat podataka (gena, proteina,...) na primjeru jednog ciljanog organizma, grupe organizama, lokusa, mjesta ekspresije itd.
- navesti glavne predstavnike suvremene tehnologije sekvencioniranja i prodiskutirati njihove prednosti/mane naspram Sanger-ove metode
- kategorizirati proteine prema odgovarajućim proteinskim porodicama
- diskutirati pojmove proteomika i funkcionalna genomika
- definirati pojam filogenije
Nastava
| Vrste nastave | sati | |
| oznaka | naziv | |
| P | Predavanja | 20 |
| A | Auditorne vježbe | |
| L | Laboratorijske vježbe | |
| PK | Vježbe u praktikumu | 10 |
| S | Seminar | 10 |
| T | Terenske vježbe | |
Nastavni materijali [2]
| Naziv datoteke | Veličina | Ubačeno/mijenjano | |
|---|---|---|---|
Seminar 1
|
415,88 kB | 02.09.2022. 17:05 | |
Seminar 2
|
959,40 kB | 02.09.2022. 17:05 |
Literatura
| red. broj | Naziv |
| 1. | Predavanja u PowerPointu |
| 2. | Jean-Michel Claverie, Cedric Notredame, Bioinformatics For Dummies, 2nd Edition (2006) Wiley Publishing, Inc., ISBN: 978-0-470-08985-9 |
| 3. | http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery |
| 4. | http://www.ebi.ac.uk/services |
| 5. | http://www.bioinformatics.org/ |
"Najbolji bioinformatičari generacije"
