Bioinformatika

en hr
Šifra:
53249
ECTS:
4.0
Nositelji:
prof. dr. sc. Antonio Starčević
Izvođači:
prof. dr. sc. Antonio Starčević - Vježbe u praktikumu

prof. dr. sc. Antonio Starčević - Seminar

prof. dr. sc. Jurica Žučko - Predavanja
Prijava ispita:
Opterećenje:
1. komponenta
Vrsta nastave Ukupno
Predavanja 20
Seminar 10
Vježbe u praktikumu 10
* Opterećenje je izraženo u školskim satima (1 školski sat = 45 minuta)
Opis predmeta:
Ciljevi:
Kroz ovaj kolegij student bi se trebao upoznati sa mogućnostima i izazovima koje pruža bioinformatika. Da bi to postigli u u zadanom vremenskom okviru, fokusirali smo se na način rada najčešće korištenih bioinformatičkih algoritama kao i pouzdanu interpretaciju njihovih rezultata. Zatim na pregled i pretraživanje brojnih mrežnih repozitorija bioloških podataka. I na kraju, osnove bioinformatičke analize pojedinačnih gena ali i genskih nakupina.

Sažetak:
Za vrijeme trajanja ovog kondenziranog kolegija, unutar četiri tjedna predavanja, studenti će se kroz predavanja, vježbe i seminare upoznati sa svim osnovnim aspektima bioinformatičke analize bioloških sekvencija. Bioinformatika kao mlada i interdisciplinarna znanstvena disciplina ima mnogo različitih pristupa, ali na kraju ovoga kolegija, student će moći samostalno rješavati osnovne bioinformatičke probleme poput primjerice: Kako doći do relevantnih informacija o ciljnim genima, gdje pribaviti sekvencije DNA i proteina, kako upravljati sekvencijama DNA i proteina na način da se na njih primjene odgovarajući računalni programi ili algoritmi te u konačnici kako podesiti parametre istih sa ciljem da analiza sekvencija rezultira biološki relevantnim saznanjima.

Potrebno predznanje:
Poznavanje osnovnih bioloških koncepata kao što su: transkripcija, translacija, homologija i stanična struktura. Osnove rada na računalu.
Ishodi učenja:
Literatura:
Preporučena literatura:
  1. , Jean-Michel Claverie, Cedric Notredame, Bioinformatics For Dummies, 2nd Edition (2006) Wiley Publishing, Inc., ISBN: 978-0-470-08985-9, , , .
  2. , http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery, , , .
  3. , http://www.ebi.ac.uk/services, , , .
  4. , http://www.bioinformatics.org/, , , .
2. semestar
Obavezni predmet - Redovni studij - Molekularna biotehnologija
Termini konzultacija: