Programiranje u bioinformatici
Šifra:
53272
ECTS:
2.0
Nositelji:
izv. prof. dr. sc.
Janko Diminić
Izvođači:
izv. prof. dr. sc.
Janko Diminić
- Vježbe u praktikumu
izv. prof. dr. sc. Janko Diminić - Seminar
prof. dr. sc. Antonio Starčević - Predavanja
izv. prof. dr. sc. Janko Diminić - Seminar
prof. dr. sc. Antonio Starčević - Predavanja
Prijava ispita:
Opterećenje:
1. komponenta
| Vrsta nastave | Ukupno |
|---|---|
| Predavanja | 10 |
| Seminar | 5 |
| Vježbe u praktikumu | 10 |
Opis predmeta:
Ciljevi
Kroz ovaj kolegij studenti bi se trebali upoznati sa računalnim vještinama i načinima rješavanja bioinformatičkih zadataka upotrebom računalnog jezika Python te razvoj vlastitih algoritama uz pomoć Jupyter Notebook razvojnog okruženja.
Sažetak
Informatičke vještine danas su vrlo tražene prilikom bioloških istraživanja. Programiranje je postalo nova važna laboratorijska disciplina. Programski jezik Python omogućava brzo pisanje programa, a biološki zadaci se in silico rješavaju upotrebom gotovih biblioteka (npr. BioPython) koje se upotrebljavaju u bioinformatici. Uobičajni zadaci su: operacije sa sekvencijama DNA i proteina, programiranje prevođenja sekvencije DNA u sekvenciju proteina, rukovanje s velikim količinama podataka, kreiranje bioloških baza podataka i drugo.
Kroz ovaj kolegij studenti bi se trebali upoznati sa računalnim vještinama i načinima rješavanja bioinformatičkih zadataka upotrebom računalnog jezika Python te razvoj vlastitih algoritama uz pomoć Jupyter Notebook razvojnog okruženja.
Sažetak
Informatičke vještine danas su vrlo tražene prilikom bioloških istraživanja. Programiranje je postalo nova važna laboratorijska disciplina. Programski jezik Python omogućava brzo pisanje programa, a biološki zadaci se in silico rješavaju upotrebom gotovih biblioteka (npr. BioPython) koje se upotrebljavaju u bioinformatici. Uobičajni zadaci su: operacije sa sekvencijama DNA i proteina, programiranje prevođenja sekvencije DNA u sekvenciju proteina, rukovanje s velikim količinama podataka, kreiranje bioloških baza podataka i drugo.
Ishodi učenja:
Literatura:
Preporučena literatura:
- Python for Bioinformatics (Chapman & Hall/CRC Mathematical and Computational Biology), Python for Bioinformatics (Chapman & Hall/CRC Mathematical and Computational Biology) ISBN-978-1138035263, Sebastián Bassi, , .
1. semestar
Molekularna biotehnologija - A1
-
Redovni
studij
-
Molekularna biotehnologija
Izborni predmet
-
Redovni
studij
-
Molekularna biotehnologija
3. semestar
Bioprocesno inženjerstvo - B1
-
Redovni
studij
-
Bioprocesno inženjerstvo
Izborni predmet
-
Redovni
studij
-
Bioprocesno inženjerstvo
Molekularna biotehnologija - A1
-
Redovni
studij
-
Molekularna biotehnologija
Izborni predmet
-
Redovni
studij
-
Molekularna biotehnologija
Prehrambeno inženjerstvo - B1
-
Redovni
studij
-
Prehrambeno inženjerstvo
Izborni predmet
-
Redovni
studij
-
Prehrambeno inženjerstvo
Upravljanje sigurnošću hrane - B1
-
Redovni
studij
-
Upravljanje sigurnošću hrane
Izborni predmet
-
Redovni
studij
-
Upravljanje sigurnošću hrane
Termini konzultacija: