Mikrobna ekologija

en hr
Šifra:
166959
ECTS:
3.0
Nositelji:
prof. dr. sc. Blaženka Kos
Izvođači:
prof. dr. sc. Blaženka Kos - Seminar
izv. prof. dr. sc. Andreja Leboš Pavunc - Seminar
prof. dr. sc. Jasna Novak - Seminar

izv. prof. dr. sc. Andreja Leboš Pavunc - Predavanja
prof. dr. sc. Jasna Novak - Predavanja

dr. sc. Martina Banić - Laboratorijske vježbe
Katarina Butorac , mag. ing. biotechn. - Laboratorijske vježbe
prof. dr. sc. Blaženka Kos - Laboratorijske vježbe
izv. prof. dr. sc. Andreja Leboš Pavunc - Laboratorijske vježbe
prof. dr. sc. Jasna Novak - Laboratorijske vježbe
Prijava ispita:
Opterećenje:
1. komponenta
Vrsta nastave Ukupno
Predavanja 22
Seminar 5
Laboratorijske vježbe 5
* Opterećenje je izraženo u školskim satima (1 školski sat = 45 minuta)
Opis predmeta:
1.Mikrobne interakcije unutar združenih mikrobnih zajednica
P: Temeljni principi mikrobne ekologije. Interakcije u združenim mikrobnim zajednicama usne šupljine, urogenitalnog i gastrointestinalnog trakta. Kategorije međusobnih odnosa mikroorganizama u mikrobnim zajednicama usne šupljine, urogenitalnog i gastrointestinalnog trakta. Quorum sensing sustavi. Mikrobni biofilmovi. Primjena mikrobnih biofilmova u biotehnološkim procesima
S: Mikrobne interakcije u različitim okolišnim uvjetima i identifikacija interakcijskih mehanizama.
V:Karakterizacija svojstava površine bakterijskih stanica, Mikrobna adhezija na otapala (MATS)

2.Suvremeni pristupi istraživanjima mikrobnih zajednica
P: Primjena molekularnih metoda u istraživanju bioraznolikosti mikrobnih zajednica. Autekologija i sinekologija, dva osnovna pristupa istraživanju mikrobnih zajednica. In vitro kemostat i kontinuirani modeli gastrointestinalnog trakta.
S: Primjena PCR-DGGE u istraživanju bioraznolikosti mikrobnih zajednica.
V: Izolacija ukupne DNA iz mješovite mikrobne populacije ekosustava. Identifikacija pojedinačnih bakterijskih sojeva iz mješovite kulture sekvencioniranjem 16S rRNA gena i sekvencioniranje metagenoma.

3. Mikrobna ekologija usne šupljine, urogenitalnog gastrointestinalnog trakta
P: Mikrobna ekologija gastrointestinalnog sustava. Metaboličke interakcije u gastrointestinalnom sustavu. Mikrobna ekologija usne šupljine. Mikrobna ekologija urogenitalnog trakta.
S: Mikrobna ekologija usne šupljine, urogenitalnog i gastrointestinalnog trakta
V: Formiranje biofilma: adhezija bakterijskih stanica na polistiren i na glikoprotein mucin.
Ishodi učenja:
Literatura:
  1. 1. J. Šušković, B. Kos, J. Novak: Mikrobna ekologija (Interna skripta, predavanja)
    2. Poglavlje iz Priručnika za vježbe iz opće mikrobiologije (izdavač: Hrvatsko mikrobiološko društvo, 2016, ur. Danko Hajsig i Frane Delaš): B. Kos, J. Novak: Mikrobni biofilm, str. 157-162.
    3. J. Šušković, B. Kos, J. Novak, A. Leboš Pavunc: Mikrobna ekologija, Laboratorijske vježbe (Interna skripta),
2. semestar
Molekularna biotehnologija - A2 - Redovni studij - Molekularna biotehnologija
Termini konzultacija: