Računalni alati za modeliranje prehrane ljudi

en hr
Šifra:
253099
ECTS:
3.0
Nositelji:
izv. prof. dr. sc. Ana Jurinjak Tušek
Izvođači:
izv. prof. dr. sc. Maja Benković - Vježbe u praktikumu
prof. dr. sc. Jasenka Gajdoš Kljusurić - Vježbe u praktikumu
doc. Tamara Jurina - Vježbe u praktikumu
izv. prof. dr. sc. Ana Jurinjak Tušek - Vježbe u praktikumu
izv. prof. dr. sc. Davor Valinger - Vježbe u praktikumu

izv. prof. dr. sc. Ana Jurinjak Tušek - Seminar

izv. prof. dr. sc. Maja Benković - Predavanja
prof. dr. sc. Jasenka Gajdoš Kljusurić - Predavanja
doc. Tamara Jurina - Predavanja
izv. prof. dr. sc. Davor Valinger - Predavanja
Prijava ispita:
Opterećenje:
1. komponenta
Vrsta nastave Ukupno
Predavanja 10
Seminar 5
Vježbe u praktikumu 25
* Opterećenje je izraženo u školskim satima (1 školski sat = 45 minuta)
Opis predmeta:
Današnje generacije vrlo su vješte u digitalnom okruženju te bi kroz kolegij koji primjenjuje računala u praćenju metabolizma zdravog i/ili bolesnog čovjeka mogli na njima prihvatljiv način povezati prethodno stečena znanja i vještine iz biologije, biokemije, fiziologije čovjeka i sl. Kolegij podrazumijeva poznavanje rada na računalu te osnovna znanja iz područja biologije i biokemije. Kroz kolegij će se dati pregled osnova iz primjene modeliranja metaboličkih procesa na razini ljudske stanice, važnih za planiranje i optimiranje prehrane. Korištenje alata računalne biologije osigurava brz i jednostavan uvid u djelovanje prehrane na metaboličke procese i homeostazu stanice te opisuje kako je regulacija tih procesa narušena bolestima vezanim uz prehranu.
U okviru kolegija studenti će se upoznati s radom u programskim paketima za analizu metabolizma na razini ljudske stanice s posebnim naglaskom na CellDesigner. CellDesigner omogućava jednostavnu analizu metaboličkih procesa na razini ljudske stanice korištenjem detaljnog popisa simbola staničnih komponenti. Kroz rad na vježbama i kroz seminar će se raditi na primjerima kako bi primjena modela metabolizma na razini ljudske stanice postala dio rutine pri planiranju prehrane, posebno u slučaju bolesti izazvanih poremećajima metabolizma. Također će se simulirati efekt kontaminacije (primjer arsena u vodi za piće). Ovaj kolegij je predviđen za studente koji su u završnoj fazi studija jer uključuje povezivanje znanja stečenih tijekom studija.
Ishodi učenja:
Literatura:
  1. Analysis of Hepatic Lipid Metabolism Model: Simulation and Non-Stationary Global Sensitivity Analysis, doi:10.3390/nu14234992, Kosić, Martina; Benković, Maja; Jurina, Tamara; Valinger, Davor; Gajdoš Kljusurić, Jasenka; Jurinjak Tušek, Ana, Nutrients, 2022.
  2. Application of CellDesigner program for nutrition planning and food safety control, Marić, Lucija; Malešić, Elena; Šanko, Katarina; Jurina, Tamara; Valinger, Davor; Gajdoš Kljusurić, Jasenka; Benković, Maja; Jurinjak Tušek, Ana, Journal on Processing and Energy in Agriculture, 2019.
Preporučena literatura:
  1. Systems Biology Approaches to Nutrition, , Fleet, J. C., John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, NJ, SAD., 2012.
  2. Mathematical modeling of gene regulatory networks, , Tušek, Ana; Želimir Kurtanjek, InTech, 2012.
  3. Gender specific differences of the ethanol and nicotine toxicity verified by the use of mathematical models, , Tušek, Kristina; Buntak, Ivana; Gajdoš Kljusurić, Jasenka; Jurinjak Tušek, Ana, Croatian Journal of Food Science and Technology, 2019.
3. semestar
Nutricionizam (diplomski) - izborni B - 3. semestar - Redovni studij - Nutricionizam
Termini konzultacija: