U prostorijama Zavoda za tehničku botaniku i mikroskopiju Tehničkog fakulteta Sveučilišta u Zagrebu, Kršnjavoga 25, osnovanje 1956. Laboratorij za mikrobiologiju pri Prehrambenom odjelu Tehnološkog fakulteta. Preseljenjem Laboratorija za mikrobiologiju u novu zgradu, Pierottijeva ulica 6, osniva se 1960./61. Laboratorij za biologiju s tehničkom mikroskopijom u sastavu Zavoda za mikrobiologiju. Predstojnik Laboratorija je prof. dr. sc. Anto Jurilj, koji ostaje na toj dužnosti do 1979. god. Znanstvena aktivnost Laboratorija odnosila se na područje filogenije i sistematike algi kremenašica, te mikrobiologije cerealija.

Istovremeno se, u Laboratoriju za industrijsku mikrobiologiju, pod vodstvom dr.sc. Marije Alačević počinje u nas razvijati novo područje istraživanja, genetika industrijskih mikroorganizama.

Godine 1979. pročelnik Laboratorija za biologiju postaje prof.dr.sc. Marija Alačević. Pod nazivom Laboratorij za biologiju i genetiku mikroorganizama djeluje danas unutar Zavoda za biokemijsko inženjerstvo Prehrambeno-biotehnološkog fakulteta.

U tom periodu znanstvenoistraživački rad Laboratorija obuhvaća istraživanja na području mikrobne i molekularne genetike. Posebno je težište na oplemenjivanju industrijskih mikroorganizama primjenom klasičnih genetičkih metoda i metoda rekombinantne DNA, te na proučavanju molekularnih mehanizama mutageneze i popravka DNA. U Laboratoriju se vrši i ispitivanje genotoksičnosti agenasa iz okoline. Laboratorij ima razvijenu suradnju s prehrambenom i farmaceutskom industrijom, te s mnogim istraživačkim institutima u zemlji i inozemstvu.

Odlaskom prof.dr.sc. Marije Alačević u mirovinu 1994. godine pročelnica Laboratorija je prof.dr.sc. Jasna Franekić Čolić. Od 2011. do 2013. godine te od 2015. do 2021. godine tu je dužnost imao prof. dr. sc. Ivan-Krešimir Svetec, a od 2013. do 2014. godine izv. prof. dr. sc. Lidija Šver.