Molekularno-genetičke metode u kontroli mikrobiološke sigurnosti hrane

Opis predmeta

SADRŽAJ PREDMETA

Područja primjene molekularno-genetičkih metoda. Struktura i funkcija molekule DNA. Geni i genomi prokariota i eukariota. Svrha i ciljevi molekularno-genetičke analize. Sekvencije pogodne za analizu i principi laboratorijski postupaka koji se provode pri molekularno-genetičkoj analizi. Metode PCR, qPCR, RAPD, elektroforeza DNA, cijepanje DNA restrikcijskim enzimima, RFLP, Southern blot, sekvencioniranje DNA, FISH, microarray, AFLP. Prezentacije i rasprava znanstvenih radova u kojima se primjenjuju molekularno-genetičke metode.

ISHODI UČENJA

1. Izraditi hodogram provedbe i na molekularnom nivou objasniti provedbu molekulaerno genetičkih metoda kao što su PCR, qPCR, RAPD, RFLP, Southern blot, sekvecnioniranje DNA, analiza uzastopnih i raspršenih ponavljanja te AFLP i microarray. 
2. Predvidjeti i interpretirati rezultate molekularno genetičke analize te crtežom, na molekularnom nivou, prikazati pojedine faze tijekom provedbe metode. 
3. Predložiti odgovarajuće metodu za provedbu određene analize te predložiti modifikaciju metode, odnosno izraditi hodogram nove, modificirane metode. 
4. Samostalno analizirati i evaluirati znanstveni rad u kojemu se primjenjuju molekularno-genetičke metode te ga na primjeren način prezentirati svojim kolegama, odgovarati na postavljena pitanja i sudjelovati u znanstvenoj diskusiji.

Nastava

20 (10 predavanja + 10 seminara)

Literatura

1. Ambriović Ristov, A. (2007), Metode u molekularnoj biologiji, Institut Ruđer Bošković
2. Dale, J. W. and Park S. F. (2004), Molecular Genetics of Bacteria, J. Wiley & Sons
3. Lewin, B. (2008), Genes IX, Pearson Education
4. Brenner, S. and J.K. Miller (eds.) (2001), Encyclopedia of Genetics, Academic Press
5. Principles of gene manipulation and genomics, 7th edition, S.B. Primrose and R.M. Twyman, Blackwell Publishing, 2006.
6. Gene cloning and DNA analysis, 5th edition, T.A. Brown, Blackwell Publishing, 2006.
7. Molecular cloning: A laboratory manual, 3rd ed. Vols 1, 2 and 3. J. Sambrook, E.F. Fritsch and T.Maniatis, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, 2001.
8. Short protocols in molecular biology, 5th ed. Vols 1 and 2. F.M. Ausubel, R. Brent, R.E. Kingston, D.D. Moore, J.G. Seidman, J.A. Smith and K. Struhl, J. Willey and Sons, 2002.
9. Originalni znanstveni radovi